Все эти эпизоды по праву можно считать предтечей к кроссоверу с Элмайрой Дафф, которая также появилась в "Animaniacs" единственный раз - в 64-м эпизоде "Lookit the Fuzzy Heads", где на приёме у психиатра Отто Скретчанниффа гонялась за Уорнерами и мучила их. В итоге Якко выманил Минди из дома заводной игрушкой, и Элмайра уже погналась за ней к великой радости Баттонса. За кадром звучали американские песни про животных: "The Old Grey Mare", "The Animal Fair", "Oh Where Oh Where Has My Little Dog Gone" and "The Bear Went Over the Mountain".
И, тем не менее, встреча Пинки и Брейна с Элмайрой Дафф таки состоялась в Specials - двух специальных эпизодах вселенной "Tiny Toon Adventures" ("Приключения мультяшек"):"Tiny Toons Spring Break Special" и "Tiny Toons: Night Ghoulery" ("Приключения мультяшек : весенние каникулы") и "Приключения мультяшек: Ночной кошмар"). Если в первом Пинки и Брейн не говорят ни слова и показаны как пойманные Элмайрой Дафф зверушки (что уже выглядит символично по тем временам, учитывая то, что годами позже будет снят отдельный мультсериал про мышей с ее участием), то во втором появляется только один Брейн - ради шутки в качестве игры слов.
Напомним, эпизод называется "Франкенмайра и Диззигор", пародирующий сюжет фильма ужасов "Франкенштейн" 1930-х -1940- х годов. Элмайра выступает в роли доктора Виктора Франкенштейна, тасманский дьявол Диззи - в роли горбуна Игоря, придуманного специально для фильма (в оригинале книги Мэри Шелли такого персонажа нет), а Госсамер - в роли безымянного Чудовища, созданного Франкенштейном. По сюжету короткометражки Элмайра (известная как Франкенмайра) просит своего слугу - горбуна Диззигора принести ей мозг для ее монстра. Диззи опустошает банку, в которой находится мышь Брейн. Лабораторный грызун сообщает, скрестив лапы на груди: "Очевидная природа этого каламбура принижает нас всех". Затем Элмайра говорит Брейну: "О, я поиграю с тобой позже!", что является возможным предзнаменованием для создания неудачного спин-оффа.
В немногих эпизодах мультсериала "Animaniacs" ("Озорные анимашки") в рамках собственного сегмента Пинки и Брейн не всегда были показаны в лаборатории АКМЕ, в которой в заставке каждого эпизода песню про них, как и про Белку Слэппи, исполняли братья Уорнеры и их сестра Дот. Им давали больше свободы передвижения, в одном из эпизодов мыши даже жили в клетке у волшебника Мерлина в качестве его фамильяров, в другом - попытались подменить Декларацию Независимости США, а в третьем - стащить молнию у самого Зевса, взобравшись на Олимп верхом на Пегасе. Брейн также начал представляться другим персонажам под новыми именами (или псевдонимами), такими как Джон Брейн и Бубба Бо Боб Брейн. Пилотным эпизодом "Аниманьяков" стал "Win Big" ("Выиграй по-крупному"), где Брейн принял участие в шоу "Gyp-Parody", похожем на нашу "Свою игру" (её американским аналогом была передача "Jeopardy!") с целью выиграть 99 000 долларов, чтобы закончить свое устройство и захватить мир. В этом эпизоде Брейн впервые появляется в своём фирменном человеческом костюме-роботе, состоящего из белого низа, чёрного пиджака, такого же цвета брюк и красного галстука-бабочки, который мы вскоре увидим в нескольких других эпизодах мультсериала "Пинки и Брейн", созданного чуть позже.
Подобно Рубену Гаррету Люциусу Голдбергу (англ. Rube Goldberg), мышь Брейн также являлся изобретателем в каждом эпизоде, а не только просто разрабатывал планы по захвату мира. Так, в эпизоде "Бубба Бо Боб Брейн" грызун изобрёл ходули, чтобы замаскироваться под известного певца в пародии на Билли Рэя Сайруса и его печально известную песню «Achy Breaky Heart», а также - Элвиса Пресли в одном лице, а Пинки играл роль его менеджера - Полковника Пинки (пародия на Тома Паркера, менеджера Элвиса Пресли). В серии "The Brain's Apprentice" ("Ученик Брейна") 1997 года изобретением мыша стала машина, воспроизводящая целую армию роботов, с помощью которых Брейну почти удалось захватить мир. Хотя продюсер и сценарист Питер Гастингс заявил, что Брейн должен был только угрожать причинить вред Пинки, но никогда на самом деле не бить его, потому что он чувствовал, что это и выглядит смешнее, и больше подходит персонажу, Том Рюггер и другие продюсеры часто заставляли грызуна по-настоящему наносить удары Пинки, делая его похожим в этом плане на астматичного чихуахуа Рена Хоека из "Шоу Рена и Стимпи". Даже в самой первой короткометражке "Win Big" Брейн доводит дело до конца.
9 сентября 1995 года Пинки и Брейн официально отделились от вселенной "Animaniacs" и были единственными персонажами, у которых, как и у Плаки Дака, было своё собственное шоу, но на сей раз - успешное, насчитываемое аж 65 эпизодов, даже несмотря на то, что некоторые из серий, уже показанные раннее, повторялись. Повторы транслировались на американских каналах, таких как: The WB, Kids WB, Cartoon Network, Nickelodeon, Nicktoons и Disney XD. И в рамках 61 эпизода 3 сезона "Пинки и Брейна" под названием